Управление деятельностью в области торгового мореплавания в России длительное время осуществлялось на базе структуры специальных должностных лиц – капитанов морских портов, входящих в состав федеральных бюджетных учреждений – Администраций морских портов. Такая схема географического распределения всех административных функций государства в полной мере соответствовала структуре морского судоходства, сформировавшейся в региональном измерении.